زگیل های ویروسی را می توان به صورت زیر طبقه بندی کرد:
بدون تمایل دژنراتیو
- Verruca vulgaris (زگیل مبتذل ؛ HPV 1 ، 2 ، 3 ، 4).
- Verruca plantaris (مترادف: زگیل کف پا ، زگیل کف پا / زگیل پا ، Myrmecia ؛ HPV 1 ، 4).
- Verruca plana (زگیل تخت ؛ HPV 3 ، 10 ، 28 ، 41).
- زگیل موزاییکی (HPV 2)
- فیلی فرم زگیل (زگیل های نازک و موخوره ؛ HPV 7 ؛ معمول در قصابی).
- هیپرپلازی کانونی اپیتلیال (HPV 13 ، 32).
- پاپیلومات ملتحمه (HPV 6، 11) - پاپیلومای روی ملتحمه.
با گرایش به انحطاط
- Epidermodysplasia verruciformis (EV ؛ مترادف: دیسپلازی Lewandowsky-Lutz ؛ اپیدرمودایسپلازی verruciformis Lutz-Lewandowsky ؛ صاف زگیل (HPV 5 ، 8 ، 9 ، 12 ، 14 ، 15 ، 17 ، 19 ، 20 ، 21 ، 47) - ژنودرماتوز اتوزومال مغلوب بسیار نادر (ارثی پوست بیماری).
- کندیلوما آکومیناتوم (مترادف: کندیلوم توری / اوج کندیلوم ، کندیلوم نوک تیز ، زگیل تناسلی /تب زگیل ، مرطوب نوک پستانو زگیل تناسلی HPV 6 ، 11 ، 40 ، 42 ، 43 ، 44).
- کندیلوما پلانوم (کندیلوم مسطح ؛ HPV 6 ، 11 ، 16 ، 18 ، 31 و غیره)
- کندیلومای غول پیکر (HPV 6 ، 11)
- پاپیلومای حنجره (6 و 11) - پاپیلوم در ناحیه قارچ حنجره.
- پاپولوز بوونوئید (HPV 16 ، 18).
- نئوپلازی داخل اپیتلیال دهانه رحم (HPV 16 ، 18 ، 31 ، 45).