جهش ویروس کرونا

جهش طبیعی است

ظهور گونه‌های ویروسی جدید چیز غیرعادی نیست: ویروس‌ها - از جمله پاتوژن Sars-CoV-2 - در طول تکثیر مکرراً مواد ژنتیکی خود را به‌طور تصادفی تغییر می‌دهند. بیشتر این جهش ها بی معنی هستند. با این حال، برخی از آنها برای ویروس مفید هستند و تثبیت می شوند.

به این ترتیب ویروس ها می توانند به سرعت با محیط و میزبان خود سازگار شوند. این بخشی از استراتژی تکاملی آنهاست.

WHO انواع جدید را بر اساس دسته های زیر طبقه بندی می کند:

انواع تحت نظارت (VBM) - انواع با تغییرات ژنتیکی که می تواند به معنای خطر بالاتر باشد، اما با اثراتی که هنوز مشخص نیست.
نوع مورد علاقه (VOI): واریته‌هایی که دارای ویژگی‌های ژنتیکی هستند که پیش‌بینی‌کننده قابلیت انتقال بالاتر، دور زدن ایمنی یا تست‌های تشخیصی، یا بیماری شدیدتر در مقایسه با اشکال قبلی هستند.
نوع پیامد بالا (VOHC) – نوع با پیامد بالا: گونه‌ای که واکسن‌های فعلی هیچ محافظتی در برابر آن ارائه نمی‌کنند. تا به امروز، هیچ گونه SARS-CoV-2 در این دسته وجود نداشته است.

تغییرات ویروسی به اصطلاح به کلادها یا دودمان گروه بندی می شوند - بنابراین محققان به طور سیستماتیک "شجره خانواده کرونا" را ثبت و مستند می کنند. هر گونه با توجه به ویژگی های ارثی آن مشخص می شود و ترکیبی از حروف-عدد اختصاص داده می شود. با این حال، این نام نشان نمی دهد که آیا یک سویه خاص از ویروس خطرناک تر از دیگری است یا خیر.

ویروس کرونا چگونه تغییر می کند؟

دو راه برای تکامل «موفقیت‌آمیز» کروناویروس وجود دارد: به گونه‌ای تغییر می‌کند که بهتر می‌تواند وارد سلول انسان شود، بنابراین عفونی‌تر می‌شود، یا سعی می‌کند با سازگاری از سیستم ایمنی ما «فرار» کند:

جهش فرار: اینها تغییراتی هستند که ویروس کرونا را قادر می‌سازد تا از سیستم ایمنی فرار کند. سپس ویروس شکل خارجی خود را تغییر می دهد به گونه ای که آنتی بادی های (از قبل تشکیل شده) عفونت یا واکسیناسیون اولیه اکنون کمتر قادر به "تشخیص" و خنثی کردن آن هستند. به این "جهش های فرار" یا "فرار ایمنی" نیز گفته می شود. بنابراین احتمال عفونت دوم بیشتر می شود.

انواع ویروس چگونه ایجاد می شود؟

هرچه این بیماری همه گیر بیشتر طول بکشد، عفونت ها بیشتر، تغییرات و جهش های ویروس کرونا بیشتر می شود.

همه گیری کرونا در حال حاضر برای دو سال خوب ادامه داشته است: از 05 ژانویه 2022، مرکز منابع کروناویروس جانز هاپکینز (CRC) اکنون حدود 296 میلیون مورد عفونت را در سراسر جهان گزارش کرده است.

فرصت کافی برای کروناویروس برای انباشتن چندین تغییر (تغییر) در ماده ژنتیکی.

این تعداد بسیار زیاد موارد - و تغییرات ژنتیکی همراه در Sars-CoV-2 - در گسترش گسترده تعداد زیادی از انواع ویروس جدید منعکس شده است:

دلتا: تبار B.1.617.2

نوع دلتا (B.1.617.2) Sars-CoV-2 نیز در ماه های اخیر (پاییز 2021) به سرعت در آلمان گسترش یافت. اولین بار در هند کشف شد و به سه نوع فرعی تقسیم می شود که چندین تغییر مشخصه را ترکیب می کند.

از یک طرف، این تغییرات در پروتئین سنبله است که "کلید" برای سلول انسانی در نظر گرفته می شود. از سوی دیگر، B.1.617 نیز تغییراتی را نشان می دهد که به عنوان یک جهش (احتمالی) گریز مورد بحث قرار می گیرد.

به طور خاص، B.1.617 جهش‌های مربوطه زیر را ترکیب می‌کند:

جهش D614G: می تواند ویروس کرونا را مسری تر کند. مدل‌سازی اولیه نشان می‌دهد که این امر باعث می‌شود B.1.617 حداقل به راحتی به عنوان نوع آلفای بسیار مسری (B.1.1.7) منتقل شود.

جهش P681R: همچنین توسط محققان با احتمال افزایش حدت بیماری همراه است.

جهش E484K: همچنین در نوع بتا (B.1.351) و نوع گاما (P.1) یافت شده است. گمان می رود که ویروس را نسبت به آنتی بادی های خنثی کننده ای که قبلاً تشکیل شده اند، کمتر حساس کند.

جهش L452R: همچنین به عنوان یک جهش احتمالی فرار مطرح می شود. سویه‌های کروناویروس با جهش L452R در آزمایش‌های آزمایشگاهی تا حدی به آنتی‌بادی‌های خاصی مقاوم بودند.

نوع دلتا، که تا به حال در اروپا غالب بوده است، به نظر می رسد که با گام های بزرگی توسط نوع بسیار مسری omicron جابجا شده است.

Omikron: تبار B.1.1.529

نوع Omikron جدیدترین جهش کروناویروس است که برای اولین بار در نوامبر 2021 در بوتسوانا کشف شد. اکنون به طور رسمی توسط سازمان بهداشت جهانی (WHO) به عنوان یک نوع جدید نگران کننده طبقه بندی شده است.

اریس: دودمان EG.5

نوع EG.5 ویروس کرونا از دودمان Omikron است. اولین بار در فوریه 2023 شناسایی شد. از آن زمان تاکنون در کشورهای مختلف در سراسر جهان گسترش یافته و در بسیاری از نقاط بر صحنه عفونت مسلط شده است. به نام الهه یونانی اختلاف و نزاع، اریس نیز نامیده می شود.

EG.5 از گونه های omicron XBB.1.9.2 فرود می آید. و XBB.1.5، اما یک جهش جدید در پروتئین اسپایک (F456L) نیز دارد. خط فرعی EG.5.1 همچنین حامل یک جهش Q52H دیگر است.

آیا EG.5 از انواع قبلی خطرناک تر است؟

با ظهور EG.5، تعداد موارد ابتلا به کرونا دوباره افزایش می یابد و همراه با آن، تعداد بستری ها در بیمارستان افزایش می یابد. به گفته WHO تاکنون هیچ تغییری در شدت بیماری گزارش نشده است. بنابراین WHO EG.5 را به عنوان یک نوع مورد علاقه (VOI) طبقه بندی کرده است، اما نه یک نوع نگرانی (VOC).

واکسن‌های تقویت‌کننده منطبق برای پاییز دقیقاً EG.5 را هدف قرار نمی‌دهند، بلکه یک تبار ویروسی نزدیک به هم مرتبط هستند (XBB.1.5). مطالعات بالینی اولیه نشان می دهد که واکسیناسیون تقویت کننده در برابر EG.5 نیز موثر است.

پیرولا: تبار BA.2.86

نوع ویروس BA.2.86 نیز از مشتقات omicron است. تفاوت آن با نوع قبلی BA.2 با 34 جهش جدید در پروتئین اسپایک، آن را به طور مشابه از اشکال قبلی که اخیراً Omicron بود، متفاوت می کند.

BA.2.86 چقدر رایج است؟

تا کنون، این نوع تنها در چند نفر یافت شده است. با این حال، اکنون آزمایشات کمی به طور کلی انجام شده است. به طور خاص، آزمایش‌های دقیقی که نوع ویروسی خاص را تعیین می‌کنند، نادر هستند. این واقعیت که موارد شناخته شده از سه قاره (آمریکای شمالی، آسیا و اروپا) می آیند و ارتباط مستقیمی با هم ندارند نشان می دهد که پیرولا قبلاً بدون توجه گسترش یافته است.

آیا BA.2.86 خطرناکتر از انواع قبلی است؟

آیا واکسن های سازگار شده علیه BA.2.86 موثر هستند؟

واکسن های موجود از سپتامبر برای نوع XBB.1.5 بهینه شده اند. پروتئین سنبله آن با پروتئین پیرولا در 36 بخش متفاوت است. بنابراین محافظت در برابر عفونت احتمالاً کاهش می یابد. با این حال، کارشناسان بر این باورند که محافظت در برابر دوره های شدید هنوز باقی است.

سایر انواع ویروس شناخته شده

انواع دیگری از ویروس Sars-CoV-2 نیز ایجاد شده است که با نوع وحشی آن متفاوت است - اما کارشناسان در حال حاضر آنها را به عنوان VOCs طبقه بندی نمی کنند. این سویه های ویروس به عنوان "انواع مورد علاقه" (VOI) نامیده می شوند.

هنوز مشخص نیست که این VOI های نوظهور چه تاثیری بر این همه گیری می توانند داشته باشند. اگر آنها ادعا کنند و بر سویه‌های ویروسی که در حال حاضر در گردش هستند غلبه کنند، آنها نیز می‌توانند به VOC مربوطه ارتقا داده شوند.

انواع مورد علاقه خاص

BA.4: زیرگروه Omicron، اولین بار در آفریقای جنوبی کشف شد.
BA.5: زیرگروه Omicron، اولین بار در آفریقای جنوبی کشف شد.

انواع تحت نظارت

به اصطلاح "انواع تحت نظارت" (VUM) در تمرکز گسترده است - با این حال، هنوز فقدان داده های قابل اعتماد و سیستماتیک در مورد آنها وجود دارد. در بیشتر موارد، تنها شواهدی از وجود صرف آنها در دسترس است. آنها شامل انواع پراکنده و همچنین نوادگان "تغییر یافته" جهش های شناخته شده هستند.

طبق ECDC، این VUM های نادر در حال حاضر عبارتند از:

XD - نوع اولین بار در فرانسه شناسایی شد.
BA.3 - نوع فرعی از نوع Omikron، اولین بار در آفریقای جنوبی شناسایی شد.
BA.2 + L245X - زیرگروه گونه omicron با منشاء ناشناخته.

انواع ویروس تنزل داده شده

همانطور که رویدادهای عفونت در همه گیری مداوم کرونا به طور پویا در حال تحول است، درک علمی و ارزیابی انواع ویروس در مراحل مختلف همه گیری شیوع دارد.

آلفا: تبار B.1.1.7

به گفته مقامات، نوع آلفا (B.1.1.7) کرونا دیگر به سختی در اروپا در حال گردش است. آلفا برای اولین بار در انگلستان شناسایی شد و با شروع از جنوب شرقی انگلستان، از پاییز 2020 به طور فزاینده ای در سراسر قاره اروپا گسترش یافته است.

دودمان B 1.1.7 دارای تعداد قابل توجهی تغییرات ژنی با 17 جهش بود. چندین مورد از این جهش‌ها بر پروتئین اسپایک تأثیر گذاشتند - از جمله جهش N501Y.

تصور می شود که B.1.1.7 حدود 35 درصد مسری تر از نوع وحشی Sars-CoV-2 بوده است و میزان مرگ و میر مشاهده شده در اثر عفونت (بدون واکسیناسیون قبلی) نیز افزایش یافته است. با این حال، واکسن‌های موجود، حفاظت قوی را به همراه داشتند.

آلفا در توافق با آژانس های رسمی (ECDC، CDC و همچنین WHO) به شدت در حال کاهش است.

بتا: دودمان B.1.351

جهش یافته به احتمال زیاد در نتیجه آلودگی زیاد جمعیت آفریقای جنوبی به ویروس ایجاد شده است. آفریقای جنوبی قبلاً در ماه‌های تابستان 2020 شیوع گسترده کرونا را ثبت کرده بود. به ویژه در شهرستان‌ها، ویروس احتمالاً شرایط ایده‌آلی برای انتشار جهشی پیدا کرده است.

این بدان معناست که بسیاری از مردم قبلاً در برابر شکل اصلی Sars-CoV-2 مصون بودند - ویروس باید تغییر می کرد. محققان از چنین وضعیتی به عنوان فشار تکاملی یاد می کنند. در نتیجه، یک نوع ویروس جدید غالب شد که نسبت به شکل اصلی برتری داشت، زیرا از جمله موارد دیگر، مسری تر است.

داده های اولیه حاکی از آن است که واکسن Comirnaty در برابر دودمان B.1351 نیز کارایی بالایی دارد. از سوی دیگر، VaxZevria ممکن است اثربخشی را کاهش داده باشد، طبق بیانیه اولیه نویسندگان Madhi و همکاران.

بتا در توافق با آژانس های رسمی (ECDC، CDC و همچنین WHO) در حال کاهش شدید است.

گاما: خط P.1

VOC دیگری به نام P.1 - که قبلاً با نام B.1.1.28.1 شناخته می شد و اکنون گاما نامیده می شد - برای اولین بار در دسامبر 2020 در برزیل کشف شد. P.1 همچنین دارای جهش مهم N501Y در ژنوم خود است. بنابراین، سویه ویروس P.1 بسیار مسری در نظر گرفته می شود.

گاما در ابتدا در منطقه آمازون تکامل و گسترش یافت. گسترش این نوع همزمان با افزایش بستری‌های مرتبط با کووید-19 در این منطقه در اواسط دسامبر 2020 است.

گاما در توافق با کارشناسان ECDC، CDC و WHO به شدت در حال کاهش است.

انواع کاهش تنش بیشتر

اگرچه تعداد زیادی از انواع ویروس های جدید اکنون شناخته شده اند، اما این به طور خودکار به معنای تهدید بزرگتر نیست. تأثیر چنین گونه‌هایی بر بروز عفونت (جهانی) کم بود یا سرکوب شدند. این شامل:

اپسیلون: B.1.427 و همچنین B.1.429 – اولین بار در کالیفرنیا کشف شد.
Eta: در بسیاری از کشورها شناسایی شده است (B.1.525).
تتا: قبلاً P.3 نامگذاری شده بود، اکنون کاهش یافته است، اولین بار در فیلیپین کشف شد.
کاپا: اولین بار در هند شناسایی شد (B.1.617.1).
لامبدا: اولین بار در دسامبر 2020 در پرو کشف شد (C.37).
Mu: اولین بار در ژانویه 2021 در کلمبیا کشف شد (B.1.621).
آیوتا: اولین بار در ایالات متحده آمریکا در منطقه شهری نیویورک کشف شد (B.1.526).
زتا: قبلاً P.2 نامگذاری شده بود، اکنون کاهش یافته است، اولین بار در برزیل کشف شد.

Sars-CoV-2 چقدر سریع جهش می یابد؟

در آینده، Sars-CoV-2 به سازگاری با سیستم ایمنی انسان و جمعیت (تا حدی) واکسینه شده از طریق جهش ادامه خواهد داد. اینکه چقدر سریع این اتفاق می افتد تا حد زیادی به اندازه جمعیت آلوده به طور فعال بستگی دارد.

هر چه تعداد موارد عفونت - در سطح منطقه، ملی و بین‌المللی - بیشتر باشد، ویروس کرونا بیشتر می‌شود و جهش‌ها بیشتر اتفاق می‌افتد.

با این حال، در مقایسه با سایر ویروس ها، ویروس کرونا نسبتاً کند جهش می یابد. با طول کل ژنوم Sars-CoV-2 حدود 30,000 جفت باز، کارشناسان یک تا دو جهش در ماه را فرض می کنند. در مقایسه، ویروس های آنفولانزا (آنفولانزا) دو تا چهار برابر بیشتر در همان دوره جهش می یابند.

چگونه می توانم از خود در برابر جهش های ویروس کرونا محافظت کنم؟

شما نمی توانید به طور خاص از خود در برابر جهش های فردی ویروس کرونا محافظت کنید - تنها امکان این است که آلوده نشوید.

جهش های ویروس کرونا چگونه شناسایی می شوند؟

آلمان یک سیستم گزارش دهی نزدیک برای نظارت بر ویروس های در حال گردش Sars-CoV-2 دارد که به آن «سیستم نظارت مولکولی یکپارچه» می گویند. برای این منظور، مقامات بهداشتی مربوطه، موسسه رابرت کخ (RKI) و آزمایشگاه‌های تشخیصی تخصصی از نزدیک با هم همکاری می‌کنند.

سیستم گزارش دهی در مورد جهش های مشکوک چگونه کار می کند؟

اول از همه، هر آزمایش مثبت ویروس کرونا که به صورت حرفه ای انجام شود، منوط به گزارش اجباری به بخش بهداشت عمومی مربوطه است. این شامل آزمایش‌های کرونا می‌شود که در یک مرکز آزمایش، در مطب پزشک، در داروخانه یا حتی در مراکز دولتی - مانند مدارس انجام می‌شود. با این حال، خودآزمایی خصوصی از این امر مستثنی است.

برای اطلاعات بیشتر در مورد آزمایش‌های سریع کروناویروس برای خودآزمایی، موضوع ویژه خودآزمایی کرونا ما را ببینید.

سپس RKI داده های گزارش شده و نتیجه تجزیه و تحلیل توالی را به شکل مستعار مقایسه می کند. نام مستعار به این معنی است که نمی توان در مورد یک فرد نتیجه گیری کرد. با این حال، این اطلاعات مبنای داده‌ای را برای دانشمندان و بازیگران در سیستم مراقبت‌های بهداشتی تشکیل می‌دهد تا یک نمای کلی دقیق از وضعیت همه‌گیری موجود به دست آورند. این امکان بهترین ارزیابی ممکن از وضعیت را به منظور استخراج اقدامات سیاستی (در صورت لزوم) فراهم می کند.

تجزیه و تحلیل ژنوم توالی چیست؟

تجزیه و تحلیل ژنوم توالی یک تجزیه و تحلیل ژنتیکی دقیق است. توالی دقیق واحدهای سازنده RNA را در ژنوم ویروسی بررسی می کند. این بدان معناست که ژنوم Sars-CoV-2، که شامل حدود 30,000 جفت باز است، رمزگشایی می‌شود و سپس می‌توان آن را با ژنوم ویروس کرونای نوع وحشی مقایسه کرد.

تنها از این طریق می‌توان جهش‌های فردی را در سطح مولکولی شناسایی کرد - و یک تخصیص در "شجره خانواده کروناویروس" ممکن است.

این همچنین روشن می کند که همه کشورهای جهان قادر به ردیابی دقیق شیوع انواع خاص ویروس کرونا با جزئیات نیستند. بنابراین احتمال وجود عدم قطعیت در داده های گزارش موجود وجود دارد.